Hệ thống quản lý khoa học - Xây dựng cơ sở dữ liệu và mô hình tính toán dự đoán đột biến gen SNP (Single Nucleotide Polymorphisms) đối với vật nuôi, cây trồng.

Tên nhiệm vụ:	Xây dựng cơ sở dữ liệu và mô hình tính toán dự đoán đột biến gen SNP (Single Nucleotide Polymorphisms) đối với vật nuôi, cây trồng. (Lượt xem: 485)
Mã số nghiệm vụ:	B2010-11-161
Chủ nhiệm:	Nguyễn Văn Định
Thư ký đề tài:	Nguyễn Thanh Hải
Người tham gia:	Nông Thị Huệ Phan Trọng Tiến Nguyễn Xuân Thảo Phạm Hạ Thủy
Thời gian thực hiện:	Từ ngày: 01/01/2010 - Đến ngày: 31/12/2011
Loại nhiệm vụ:	Đề tài BGD&ĐT
Mục tiêu:	Ứng dụng Tin-Sinh học vào việc nghiên cứu Sinh học phân tử bằng việc xây dựng cơ sở dữ liệu về đột biến gen SNP của Việt Nam và mô hình dự đoán đột biến gen SNP dựa trên tính toán song song
Nội dung:	Nghiên cứu, hệ thống hoá cơ sở lý lụân về sinh học phân tử và đột biến SNP. (Single Nucleotide Polymophisms). Phân tích và thiết kế hệ thống. Nghiên cứu về cấu trúc dữ liệu tin sinh học, cấu trúc CSDL SNP Phân tích thiết kế CSDL, thiết kế chức năng quản lý và khai thác CSDL Xây dựng phần mềm quản trị và khai thác CSDL. Cập nhật dữ liệu vào CSDL Tổ chức hội thảo tại trường ĐHNN Hà nội để góp ý, nhằm hoàn thiện hệ thống Nghiên cứu, xây dựng mô hình tính toán dự đoán đột biến SNP. Song song hóa mô hình dự đoán đột biến SNP. Chạy thử hệ thống, chỉnh sửa, hoàn thiện phần mềm quản trị và khai thác hệ thống SCDL. Cài đặt các phần mềm, hoàn chỉnh báo cáo đề tài. Báo cáo nghiệm thu đề tài
Tóm tắt kết quả nghiên cứu:	Nghiên cứu, hệ thống hoá cơ sở lý lụân về sinh học phân tử và đột biến SNP. (Single Nucleotide Polymophisms). Phân tích và thiết kế hệ thống. Nghiên cứu về cấu trúc dữ liệu tin sinh học, cấu trúc CSDL SNP Phân tích thiết kế CSDL, thiết kế chức năng quản lý và khai thác CSDL Xây dựng phần mềm quản trị và khai thác CSDL. Cập nhật dữ liệu vào CSDL Tổ chức hội thảo tại trường ĐHNN Hà nội để góp ý, nhằm hoàn thiện hệ thống Nghiên cứu, xây dựng mô hình tính toán dự đoán đột biến SNP. Song song hóa mô hình dự đoán đột biến SNP. Chạy thử hệ thống, chỉnh sửa, hoàn thiện phần mềm quản trị và khai thác hệ thống SCDL. Cài đặt các phần mềm, hoàn chỉnh báo cáo đề tài. Báo cáo nghiệm thu đề tài
Sản phẩm:	- 01 CSDL được thiết kế theo chuẩn quốc tế về cấu trúc dữ liệu SNP, tương tự NCBI hay DDBJ (bao gồn các dữ liệu đã ciis về SNP của vật nuôi và cây trồng trong và ngoài nước. - 01 chương trình quản lý và khai thác SNP database - 01 bản đặc tả mô hình phát hiện SNP bằng tính toán song song
Tổng kinh phí: