Chi tiết bài báo

Tên bài báo:	The Alternaria genomes database: a comprehensive resource for a fungal genus comprised of saprophytes, plant pathogens, and allergenic species (Lượt xem: 385)
Tên tạp chí:	BMC Genomics
Tạp chí thuộc:	Tạp chí KH quốc tế ISI
Chỉ số IF/H:	3.729
Năm xuất bản:	2015
Nước xuất bản:	Anh
Tác giả thuộc Học viện:	TS. Đặng Xuân Hà
Các tác giả bài báo:	Ha X Dang, Barry Pryor, Tobin Peever and Christopher B Lawrence
Tóm tắt bài báo:	"Background Alternaria is considered one of the most common saprophytic fungal genera on the planet. It is comprised of many species that exhibit a necrotrophic phytopathogenic lifestyle. Several species are clinically associated with allergic respiratory disorders although rarely found to cause invasive infections in humans. Finally, Alternaria spp. are among the most well known producers of diverse fungal secondary metabolites, especially toxins. Description We have recently sequenced and annotated the genomes of 25 Alternaria spp. including but not limited to many necrotrophic plant pathogens such as A. brassicicola (a pathogen of Brassicaceous crops like cabbage and canola) and A. solani (a major pathogen of Solanaceous plants like potato and tomato), and several saprophytes that cause allergy in human such as A. alternata isolates. These genomes were annotated and compared. Multiple genetic differences were found in the context of plant and human pathogenicity, notably the pro-inflammatory potential of A. alternata. The Alternaria genomes database was built to provide a public platform to access the whole genome sequences, genome annotations, and comparative genomics data of these species. Genome annotation and comparison were performed using a pipeline that integrated multiple computational and comparative genomics tools. Alternaria genome sequences together with their annotation and comparison data were ported to Ensembl database schemas using a self-developed tool (EnsImport). Collectively, data are currently hosted using a customized installation of the Ensembl genome browser platform. Conclusion Recent efforts in fungal genome sequencing have facilitated the studies of the molecular basis of fungal pathogenicity as a whole system. The Alternaria genomes database provides a comprehensive resource of genomics and comparative data of an important saprophytic and plant/human pathogenic fungal genus. The database will be updated regularly with new genomes when they become available. The Alternaria genomes database is freely available for non-profit use at http://alternaria.vbi.vt.edu."
Link:	https://bmcgenomics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12864-015-1430-7

Bài báo liên quan

1

ĐẶC ĐIỂM HÌNH THÁI VÀ PHÂN TỬ LOÀI Kudoa scomberomori (Myxosporea: Kudoidae) LẦN ĐẦU TIÊN GHI NHẬN Ở CÁ THU CHẤM Scomberomorus guttatus (Scombridae) TẠI VÙNG BIỂN VEN BỜ TỈNH QUẢNG BÌNH

Tác giả: TS. Nguyễn Hữu Đức

Năm xuất bản:
2018

2

Magnetic inductive heating of organs of mouse models treated by copolymer coated Fe3O4 nanoparticles

Tác giả: TS. Lê Thị Thu Hương (MT)

Năm xuất bản:
2017

3

Lattice strain in irradiated materials unveils a prevalent defect evolution mechanism

Tác giả: TS. Nguyễn Tiến Hiển

Năm xuất bản:
2018

4

Some Measures of Picture Fuzzy Sets and Their Application

Tác giả: PGS.TS. Nguyễn Văn Định
ThS Nguyễn Xuân Thảo

Năm xuất bản:
2018

5

Long-time behavior of the one-phase Stefan problem in periodic and random media

Tác giả: TS. Vũ Thị Thu Giang

Năm xuất bản:
2018

6

Fuzzy Equivalence on Standard and Rough Neutrosophic Sets and Applications to Clustering Analysis

Tác giả: ThS Nguyễn Xuân Thảo

Năm xuất bản:
2018

7

Rough Standard Neutrosophic Sets: An Application on Standard Neutrosophic Information Systems

Tác giả: ThS Nguyễn Xuân Thảo

Năm xuất bản:
2016

8

Chemical constituents of Boehmeria holosericea Blume. (Urticaceae)

Tác giả: TS. Đoàn Thị Thúy Ái
GS.TS. Phạm Văn Cường

Năm xuất bản:
2018

9

Phytochemical and cytotoxic investigations of the lichen Stereocaulon evolutum Graewe

Tác giả: TS. Vũ Thị Huyền

Năm xuất bản:
2017

10

PHÂN TÍCH CẤU TRÚC SẢN PHẨM CỦA PHẢN ỨNG GIỮA INDENO[1,2-c]ISOCHROMEN-5,11-DION VÀ 3-AMINOPROP-1-IN

Tác giả: TS. Nguyễn Thị Hiển
TS. Vũ Thị Huyền

Năm xuất bản:
2017

Tin mới
Xem nhiều nhất

Địa chỉ tra cứu danh sách các tạp chí quốc tế thuộc danh mục ISI và Scopus

Địa chỉ tra cứu danh sách các tạp chí quốc tế thuộc danh mục ISI và Scopus

HH../KH&CN đóng góp hiệu quả trong công nghiệp hóa, hiện đại hóa, nông nghiệp, nông thôn

HH../KH&CN đóng góp hiệu quả trong công nghiệp hóa, hiện đại hóa, nông nghiệp, nông thôn

Điều chỉnh gien để bù nước cho cây sau hạn hán

Điều chỉnh gien để bù nước cho cây sau hạn hán

Gel bôi tại chỗ bảo vệ nông dân khỏi tác hại của thuốc trừ sâu

Gel bôi tại chỗ bảo vệ nông dân khỏi tác hại của thuốc trừ sâu

Danh mục tạp chí quốc tế và quốc gia có uy tín trong lĩnh vực khoa học xã hội và nhân văn; lĩnh vực khoa học tự nhiên và kỹ thuật do Quỹ Phát triển khoa học và công nghệ Quốc gia công bố

Danh mục tạp chí quốc tế và quốc gia có uy tín trong lĩnh vực khoa học xã hội và nhân văn; lĩnh vực khoa học tự nhiên và kỹ thuật do Quỹ Phát triển khoa học và công nghệ Quốc gia công bố

Kết quả nổi bật

Tiến bộ kỹ thuật "Xử lý rơm tươi bằng urê làm thức ăn cho trâu bò"

Tiến bộ kỹ thuật "Xử lý rơm tươi bằng urê làm thức ăn cho trâu bò"

Thành công của đề tài khoa học và công nghệ độc lập cấp quốc gia

Thành công của đề tài khoa học và công nghệ độc lập cấp quốc gia

Tạo giống khoai tây kháng bệnh virus và mốc sương

Tạo giống khoai tây kháng bệnh virus và mốc sương

Nghiên cứu phát triển nguồn gen hoa hiên (Hemerocallis sp.) phục vụ trang trí cảnh quan tại Hà Nội

Nghiên cứu phát triển nguồn gen hoa hiên (Hemerocallis sp.) phục vụ trang trí cảnh quan tại Hà Nội

Thành công của đề tài “Nghiên cứu công nghệ sản xuất bột chè xanh uống liền” mang thương hiệu Việt

Thành công của đề tài “Nghiên cứu công nghệ sản xuất bột chè xanh uống liền” mang thương hiệu Việt

Tin tức

Địa chỉ tra cứu danh sách các tạp chí quốc tế thuộc danh mục ISI và Scopus

Địa chỉ tra cứu danh sách các tạp chí quốc tế thuộc danh mục ISI và Scopus

HH../KH&CN đóng góp hiệu quả trong công nghiệp hóa, hiện đại hóa, nông nghiệp, nông thôn

HH../KH&CN đóng góp hiệu quả trong công nghiệp hóa, hiện đại hóa, nông nghiệp, nông thôn

Điều chỉnh gien để bù nước cho cây sau hạn hán

Điều chỉnh gien để bù nước cho cây sau hạn hán

Gel bôi tại chỗ bảo vệ nông dân khỏi tác hại của thuốc trừ sâu

Gel bôi tại chỗ bảo vệ nông dân khỏi tác hại của thuốc trừ sâu

Danh mục tạp chí quốc tế và quốc gia có uy tín trong lĩnh vực khoa học xã hội và nhân văn; lĩnh vực khoa học tự nhiên và kỹ thuật do Quỹ Phát triển khoa học và công nghệ Quốc gia công bố

Danh mục tạp chí quốc tế và quốc gia có uy tín trong lĩnh vực khoa học xã hội và nhân văn; lĩnh vực khoa học tự nhiên và kỹ thuật do Quỹ Phát triển khoa học và công nghệ Quốc gia công bố

Thống kê số lượng đề tài

Thống kế số lượng bài báo

Thống kê truy cập

Lượt truy cập: 6833891
Đang trực tuyến: 290

BAN KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ - HỌC VIỆN NÔNG NGHIỆP VIỆT NAM

Địa chỉ: Trâu Quỳ - Gia Lâm - Hà Nội - Việt Nam.

Điện thoại: 84-2462617532 Fax: 84-2438276554 - Email: webmaster@vnua.edu.vn

Copyright by Ban Khoa Học Và Công Nghệ - Designed by hoangmtan@gmail.com