Chi tiết bài báo

Tên bài báo:	Transcriptome sequencing reveals altered long intergenic non-coding RNAs in lung cancer (Lượt xem: 113)
Tên tạp chí:	Genome Biology
Tạp chí thuộc:	Tạp chí KH quốc tế ISI
Chỉ số IF/H:	11.908
Năm xuất bản:	2015
Nước xuất bản:	Anh
Tác giả thuộc Học viện:	TS. Đặng Xuân Hà
Các tác giả bài báo:	Nicole M White, Christopher R Cabanski, Jessica M Silva-Fisher, Ha X Dang, Ramaswamy Govindan, Christopher A Maher
Tóm tắt bài báo:	"Background Long intergenic non-coding RNAs (lncRNAs) represent an emerging and under-studied class of transcripts that play a significant role in human cancers. Due to the tissue- and cancer-specific expression patterns observed for many lncRNAs it is believed that they could serve as ideal diagnostic biomarkers. However, until each tumor type is examined more closely, many of these lncRNAs will remain elusive. Results Here we characterize the lncRNA landscape in lung cancer using publicly available transcriptome sequencing data from a cohort of 567 adenocarcinoma and squamous cell carcinoma tumors. Through this compendium we identify over 3,000 unannotated intergenic transcripts representing novel lncRNAs. Through comparison of both adenocarcinoma and squamous cell carcinomas with matched controls we discover 111 differentially expressed lncRNAs, which we term lung cancer-associated lncRNAs (LCALs). A pan-cancer analysis of 324 additional tumor and adjacent normal pairs enable us to identify a subset of lncRNAs that display enriched expression specific to lung cancer as well as a subset that appear to be broadly deregulated across human cancers. Integration of exome sequencing data reveals that expression levels of many LCALs have significant associations with the mutational status of key oncogenes in lung cancer. Functional validation, using both knockdown and overexpression, shows that the most differentially expressed lncRNA, LCAL1, plays a role in cellular proliferation. Conclusions Our systematic characterization of publicly available transcriptome data provides the foundation for future efforts to understand the role of LCALs, develop novel biomarkers, and improve knowledge of lung tumor biology."
Link:	https://genomebiology.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13059-014-0429-8

Bài báo liên quan

1

ĐẶC ĐIỂM HÌNH THÁI VÀ PHÂN TỬ LOÀI Kudoa scomberomori (Myxosporea: Kudoidae) LẦN ĐẦU TIÊN GHI NHẬN Ở CÁ THU CHẤM Scomberomorus guttatus (Scombridae) TẠI VÙNG BIỂN VEN BỜ TỈNH QUẢNG BÌNH

Tác giả: TS. Nguyễn Hữu Đức

Năm xuất bản:
2018

2

Magnetic inductive heating of organs of mouse models treated by copolymer coated Fe3O4 nanoparticles

Tác giả: TS. Lê Thị Thu Hương (MT)

Năm xuất bản:
2017

3

Lattice strain in irradiated materials unveils a prevalent defect evolution mechanism

Tác giả: TS. Nguyễn Tiến Hiển

Năm xuất bản:
2018

4

Some Measures of Picture Fuzzy Sets and Their Application

Tác giả: PGS.TS. Nguyễn Văn Định
ThS Nguyễn Xuân Thảo

Năm xuất bản:
2018

5

Long-time behavior of the one-phase Stefan problem in periodic and random media

Tác giả: TS. Vũ Thị Thu Giang

Năm xuất bản:
2018

6

Fuzzy Equivalence on Standard and Rough Neutrosophic Sets and Applications to Clustering Analysis

Tác giả: ThS Nguyễn Xuân Thảo

Năm xuất bản:
2018

7

Rough Standard Neutrosophic Sets: An Application on Standard Neutrosophic Information Systems

Tác giả: ThS Nguyễn Xuân Thảo

Năm xuất bản:
2016

8

Pileamartines A and B: Alkaloids from Pilea aff. martinii with a new carbon skeleton

Tác giả: TS. Đoàn Thị Thúy Ái
GS.TS. Phạm Văn Cường

Năm xuất bản:
2018

9

Chemical constituents of Boehmeria holosericea Blume. (Urticaceae)

Tác giả: TS. Đoàn Thị Thúy Ái
GS.TS. Phạm Văn Cường

Năm xuất bản:
2018

10

Phytochemical and cytotoxic investigations of the lichen Stereocaulon evolutum Graewe

Tác giả: TS. Vũ Thị Huyền

Năm xuất bản:
2017

Tin mới
Xem nhiều nhất

Địa chỉ tra cứu danh sách các tạp chí quốc tế thuộc danh mục ISI và Scopus

Địa chỉ tra cứu danh sách các tạp chí quốc tế thuộc danh mục ISI và Scopus

Điều chỉnh gien để bù nước cho cây sau hạn hán

Điều chỉnh gien để bù nước cho cây sau hạn hán

Gel bôi tại chỗ bảo vệ nông dân khỏi tác hại của thuốc trừ sâu

Gel bôi tại chỗ bảo vệ nông dân khỏi tác hại của thuốc trừ sâu

Danh mục tạp chí quốc tế và quốc gia có uy tín trong lĩnh vực khoa học xã hội và nhân văn; lĩnh vực khoa học tự nhiên và kỹ thuật do Quỹ Phát triển khoa học và công nghệ Quốc gia công bố

Danh mục tạp chí quốc tế và quốc gia có uy tín trong lĩnh vực khoa học xã hội và nhân văn; lĩnh vực khoa học tự nhiên và kỹ thuật do Quỹ Phát triển khoa học và công nghệ Quốc gia công bố

Tiến bộ kỹ thuật "Xử lý rơm tươi bằng urê làm thức ăn cho trâu bò"

Tiến bộ kỹ thuật "Xử lý rơm tươi bằng urê làm thức ăn cho trâu bò"

Địa chỉ tra cứu danh sách các tạp chí quốc tế thuộc danh mục ISI và Scopus

Địa chỉ tra cứu danh sách các tạp chí quốc tế thuộc danh mục ISI và Scopus

Kết quả nổi bật

Tiến bộ kỹ thuật "Xử lý rơm tươi bằng urê làm thức ăn cho trâu bò"

Tiến bộ kỹ thuật "Xử lý rơm tươi bằng urê làm thức ăn cho trâu bò"

Thành công của đề tài khoa học và công nghệ độc lập cấp quốc gia

Thành công của đề tài khoa học và công nghệ độc lập cấp quốc gia

Tạo giống khoai tây kháng bệnh virus và mốc sương

Tạo giống khoai tây kháng bệnh virus và mốc sương

Nghiên cứu phát triển nguồn gen hoa hiên (Hemerocallis sp.) phục vụ trang trí cảnh quan tại Hà Nội

Nghiên cứu phát triển nguồn gen hoa hiên (Hemerocallis sp.) phục vụ trang trí cảnh quan tại Hà Nội

Thành công của đề tài “Nghiên cứu công nghệ sản xuất bột chè xanh uống liền” mang thương hiệu Việt

Thành công của đề tài “Nghiên cứu công nghệ sản xuất bột chè xanh uống liền” mang thương hiệu Việt

Tin tức

Địa chỉ tra cứu danh sách các tạp chí quốc tế thuộc danh mục ISI và Scopus

Địa chỉ tra cứu danh sách các tạp chí quốc tế thuộc danh mục ISI và Scopus

Điều chỉnh gien để bù nước cho cây sau hạn hán

Điều chỉnh gien để bù nước cho cây sau hạn hán

Gel bôi tại chỗ bảo vệ nông dân khỏi tác hại của thuốc trừ sâu

Gel bôi tại chỗ bảo vệ nông dân khỏi tác hại của thuốc trừ sâu

Danh mục tạp chí quốc tế và quốc gia có uy tín trong lĩnh vực khoa học xã hội và nhân văn; lĩnh vực khoa học tự nhiên và kỹ thuật do Quỹ Phát triển khoa học và công nghệ Quốc gia công bố

Danh mục tạp chí quốc tế và quốc gia có uy tín trong lĩnh vực khoa học xã hội và nhân văn; lĩnh vực khoa học tự nhiên và kỹ thuật do Quỹ Phát triển khoa học và công nghệ Quốc gia công bố

Hội thảo phát triển nông nghiệp Tây Nguyên: Góc nhìn từ các nông dân tỷ phú

Hội thảo phát triển nông nghiệp Tây Nguyên: Góc nhìn từ các nông dân tỷ phú

Thống kê số lượng đề tài

Thống kế số lượng bài báo

Thống kê truy cập

Lượt truy cập: 439171
Đang trực tuyến: 226

BAN KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ - HỌC VIỆN NÔNG NGHIỆP VIỆT NAM

Địa chỉ: Trâu Quỳ - Gia Lâm - Hà Nội - Việt Nam.

Điện thoại: 84-2462617532 Fax: 84-2438276554 - Email: webmaster@vnua.edu.vn

Copyright by Ban Khoa Học Và Công Nghệ - Designed by hoangmtan@gmail.com